明万历六年（1578年）四月，赵邦秩到海门上任入县境时，夜宿通州旅馆，他谢绝地方上的设宴招待，连一碗蔬菜钱也不肯让地方上负担。到任后，首先接触民众，体察民情。根据海门的实际情况，妥善安排因灾而流亡外地人员的生活，同时奏请豁免坍地赋税。当时海门沿袭惯例为朝廷养种马，每年耗费银万两，但却不能进贡一匹能产驹的种马。他立即据实报告，结果取消养马惯例。
　　一次，下乡调查民情，听到乡民为了供应里长的摊派，弄得倾家荡产，逃亡到外地去，赵邦秩勃然大怒说：“设立里长是叫他们治理乡里的，现在竟吸人膏血，任意挥霍！这一定是由于上官敲诈里役，造成里役敲诈甲长，甲长敲诈乡民，才弄得乡民逃亡外地的。”于是，赵邦秩果断地裁减里甲人员，并对贪污者予以查办，从而稳定了人心。以德施政，改变陋习。

       赵邦秩时常召集地方上的老年人，让其带领子弟到他面前，跟他们讲：“我来做你们的父母官，不仅要使你们有饭吃、有衣穿，赡养父母，抚育子女；还希望你们教育督促子女，要孝敬父母，和睦乡邻。你们各有父兄子弟，长辈能教导幼辈，幼辈能向长辈学习，就是善良的百姓。不这样做而要求人人能够善良，我想不出更好的办法！”男女老少听后，无不感动。

       有一年海门闹水灾，赵邦秩因劳累过度，突然病倒了。病危之际，有人问赵知县：“你有何家事要处理？”他只说：“海门土地坍削，民不聊生，我还有许多未完成的事要办。做官的只知官事，哪里晓得家事哩！”同僚们来看望他，他穿戴好衣帽爬下床，向他们叩头说：“我的生命就在顷刻之间，你们既关怀我，那就代我体恤这些百姓吧！假如你们不肯这样的话，我死不瞑目！”

　　不久，赵邦秩病逝，百姓无不悲痛号哭。众人集议在学宫东南角立祠，以纪念他的德行和功绩。并在祠前凿一池，名为“留惠泉”，因赵知县生前喜欢柏树，在祠堂两旁都种上柏树，起祠名为“柏林赵公祠”，每年春秋两季举行祭祀。当时的大学士李春芳、四川左布政使袁隋分别撰写《柏林赵公祠碑记》。碑记赞扬赵邦秩：“关怀百姓疾苦，犹如松柏苦心；躬行正道，犹如松柏苍劲；廉洁自守，犹如松柏情操。”